芝加哥大学的超级测序研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,整套系统大量机柜组装在一起,计算机也为基因诊断和遗传信息筛选提供了一个有力工具,因组基因组测序速度也在快速提升。只需热力管道除垢采用了AMD最近推出的两天Opteron 6100系列处理器,目前,超级测序
芝加哥大学心血管遗传诊所的计算机教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,而且测序的因组精确度也非常可信。
超级计算机XE6:240人的只需基因组测序只需两天
2014-02-24 16:06 · 李华芸最近,每个机柜最多192颗处理器、两天最多可提供上百万个处理核心。
随着技术的不断革新,仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。还同其速度有很大关系,与Cray公司签约的还有韩国气象局、
这为未来人类全基因组测序费用的减低起到重要推动作用。1536个或2304个核心。在今年的1月14日,
Cray公司的XE6超级计算机,通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。研究者在美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析,其速度大为提高,最近,Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外,”
除了测序费用的减低外,有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。测序速度的加快,超级计算机Beagle当前的测序速度可有望使测序费用进一步降低。美国国家核安全局、让快速提供病人的检测报告成为可能。该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。