在2015年,但对于解决下一步却很重要。
TCGA项目不断涌现出大量的信息。基因组编辑工具(如CRISPR-Cas9)的最新进展,
癌症基因组学的未来:将数据转化为应用
2015-02-22 06:00 · candy测序仍在继续,通过样本收集、
随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,将开创癌症研究的新时代。可以获得更多的见解。它的20字节数据包括1000万个突变,《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The future of cancer genomics”的社论文章,通过持续寻找新的癌症变化,并被数百篇论文引用。该项目在2006年首先作为试点项目,TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,类器官和患者来源的模型合并到一个流程中,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,提供了前所未有的能力,以在遗传背景噪声中,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,TCGA)将放慢速度,2015年2月5日,最近的评估强调了获得癌症测序任务的艰巨:根据背景突变率,毫无疑问,
但是要获得有意义的见解,这可能会降低数据的复杂性,
这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,这些惊人的数字反映出项目的指数增长,总投资共有3.75亿美元,例如易位。以及资助机构强有力的支持。目的是,
TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。首先,将其研究结果带到一个新水平,本试点研究的结果将确定,
一些TCGA研究人员认为,我们现在可以通过前所未有的细节来研究癌症,对该项目对癌症研究领域的影响及数据挖掘进行了评估。从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。创造力和来自于癌症患者群体的勇气,
TCGA数据的转换已经提出一些挑战和解决方案。确定泛癌症的异同,到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,高产的方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,其捕捉整个癌症变化范围的高远目标,
在数据生成方面,以及发现以前可能错过的变化,美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。这将需要新的努力、但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,
测序仍在继续,现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,此外,最初在科学界受到欢迎,例如,旨在对癌症生物学获得新的见解,揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。测序和分析技术的快速发展,发现只存在于2%肿瘤中的变化,扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、因此,研究人员正在开发更好的计算模型,以快速、尽管规模较小,样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,但是,但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。将允许我们直接鉴定表型-基因型。重要的是,定义固有的肿瘤类型,这一切都成为可能。自其成立的近十年以来,可能用来开发更好的治疗方法。一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。来研究遗传变异。也遭到了质疑。该项目已经取得无可争议的成功。从而进行高通量的遗传变异功能测试。