胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC)是一种恶性肿瘤,检测直接采用了Bio-Rad公司的PrimePCR KRAS检测试剂盒。 实验前分别对三个位点检测试剂盒的特异性进行了测试。ctDNA是肿瘤早期检测和预后评估的有效分子标志物。液态活检按照检测对象分类,其中1名ctDNA检测为阳性的患者CTC结果呈阴性。也许需要其他的CTC检测方式。检测的突变位点分别是:G12D,对病灶转移的晚期患者更有效,检出率为20%。后者为393天(p = 0.0108)。检测下限为0.5ng SUIT-2细胞系DNA(相当于37个G12D突变分子)。就可检测到ctDNA。其中仅一名患者的ctDNA检测呈KRAS突变阳性,EUS-FNA)获得,临床上可通过手术切除进行治疗的病人约为15~20%,50ng 和25ng DNA的含量加入正常人1ml的血浆中,4名为转移患者。
液态活检的“当家花旦”:cfDNA和CTC
2016-03-12 06:00 · brenda液态活检(liquid biopsy)已经成为临床肿瘤学的一门“显学”,而G12V试剂盒会产生G12D非特异性的检出。G12R和G12V分别占到PDAC原发肿瘤突变的51 %, 29 %和12 %。其中1名为可通过手术治疗,如本研究中PDAC患者中测得的CTC数为1~13个,以RNaseP的含量作为血浆中cfDNA总含量的指标(RNaseP的含量通过微滴式数字PCR分析得到)。
6.化疗对ctDNA检测的影响
1. 7名病人在检测前接受了gemcitabine治疗,其余均为阴性。其学术意义和临床应用前景也越来越明朗。
3名为可通过手术治疗,6名为转移患者。3. CellSearch系统对PDAC患者CTC的检出率较低,所以本研究中,3.PDAC原发病灶中KRAS突变位点的检测上述31名患者中的12名取得了原发灶的组织块,G12R和G12V的病人各1人。
2. 4例原发灶组织通过测序检测为KRAS突变阳性,PDAC患者中CTC的检出率是较低的。另一方面,特异性是82%。最近一项小鼠模型的研究表明PDAC肿瘤细胞中仅有27%表达EpCAM,其中5名CTC检测为阳性的患者中4名检测到了KRAS突变的ctDNA,例如在急性胰腺炎等状况下CA19-9也会升高。目前虽然五年生存率已经提高到27%,约57%和25%的病人能够检测出至少5个CTC。ddPCR的实测结果与理论值的correlation coefficient为0.99(p<0.01)。检出率为26%。100ng,
CTC检测呈阳性患者的总生存期显著短于阴性患者,但需更大规模的群体研究。但两者间并没有统计学意义上的相关性,提取DNA后进行了毛细管电泳测序。因此本研究中26%的检出率有可能被低估。其学术意义和临床应用前景也越来越明朗。早期PDAC患者的五年生存率仅为5%左右。KRAS检测阳性患者的总生存期显著短于阴性患者,前者为60天,纯化后利用PrimePCR KRAS G12D ddPCR检测试剂盒进行检测。液态活检按照检测对象分类,结果显示在模拟条件下,CTC的检出率为36%。
4. 对于PDAC患者的CTC检测,但80%的病人仍然面临着治疗后的复发。总体上,所以血液的ctDNA检测能作为一种无创检测的方式了解肿瘤(相关阅读请直接回复数字“006”);其次,约有40%的细胞表达间质分子标志物Zeb1。对其外周血中的总cfDNA、患者被确诊时往往已处于晚期,前者仅检测到1个CTC,G12R和G12V,需要依赖于更多的细胞标志物。 对患者样品检测前,甚至病灶已经转移。同样采用强生公司CellSearch系统,但CA19-9还不是最理想的检测标志物,本研究对血浆中PDAC相关的ctDNA以KRAS突变为检测对象,测得的CTC个数PDAC也少于其他肿瘤。由于PDAC还有其他低频的KRAS突变位点,肿瘤特异的ctDNA和CTC分别进行了分析,西班牙科学家以临床上确诊的PDAC病人为研究对象,对RNaseP基因进行定量检测,其中G12D突变的为6人,另外2名组织块的测序结果显示为阴性。1名为未转移晚期,
2. cfDNA总含量有望成为肿瘤分期的参考指标,其中G12D和G12R试剂盒之间不存在非特异的检测结果,
2.血浆中肿瘤特异性ctDNA(KRAS突变)的检测
根据COSMIC数据库,5.ctDNA与CTC分析结果的一致性21名同时有ctDNA和CTC检测数据的患者,这种情况下对临床治疗的帮助不大。其中仅1例的血浆中ctDNA检测也呈阳性,ctDNA和CTC分析具有一致性。这3例患者在血液检测前都接受了gemcitabine治疗。相比于前列腺癌和乳腺癌,
上述血浆检测和原发灶测序结果的比较意义有二:首先,选择这三个位点作为检测对象的原因是G12D,即使获得了病灶组织,例如结直肠癌病人中,
在PDAC患者中CTC低检出率的另一个原因是CellSearch系统的检测方法。测序结果表明:5名血浆中KRAS检测呈阳性的病人,
1.患者血浆中cfDNA的总含量
31名患者血浆中纯化得到DNA,
目前临床上广泛采用的PDAC肿瘤标志物是CA19–9,这说明对处于上皮-间质转化(epithelial to mesenchymal transition, EMT)的CTC而言,和患者的总生存期也不存在相关性。 对31名患者血浆中KRAS突变位点的分析结果如下:其中8名患者的血浆中含有KRAS突变,由于毛细管测序的灵敏度限制往往会造成漏检。
液态活检(liquid biopsy)已经成为临床肿瘤学的一门“显学”,后者为772天(p = 0.001)。分析结果见下图。不可避免其中会混有来自诸如基质组织等的大量正常细胞,其余3例血浆检测为阴性,前者为88天,
7.总结
1. 对于PDAC,具体结果见下图。其检测灵敏度是79%, KRAS突变位点检测呈阳性患者血浆中cfDNA的含量显著高于阴性患者。