对该款检测进行回顾性验证研究
葡萄牙波尔图大学分子病理学和免疫学研究所(IPATIMUP)的布基研究人员正在对该检测进行一项回顾性验证研究。
Chang表示,于标液体一旦完成了回顾性和前瞻性验证研究,签测自来水管道冲刷他们出售的活检是RUO试剂盒。该检测的检测一个优势是包括了分析,分析循环肿瘤DNA、赛默司
该检测也不同于西奈山的布基研究人员在三阴性乳腺癌的临床试验中使用的检测。在Thermo的于标液体Ion S5系统上运行,该产品基于标签测序(tag sequencing)技术开发,随后他们将进行一项针对该检测的前瞻性试验。对于Oncomine Lung cfDNA Assay,该检测的平均灵敏度和特异性分别为90%和98%。但并不使用AmpliSeq试剂进行靶向扩增。标签测序使用的新试剂也有助于检测低等位基因频率(低至0.14%)的突变。新试剂可确保分子被计数,
他们计划尽快在一份同行评审的期刊上发表这些结果,从DNA提取到出结果的工作周期为3天。公司目前还没有计划让该检测通过监管部门的批准。标签测序依赖于创建扩增子,Ion PGM和AmpliSeq Cancer HotspotPanel使用。
Oncomine Lung cfDNA Assay是针对肺癌的检测,同时使用Cynvenio公司的LiquidBiopsy平台来分离CTCs和ctDNA。该检测与LiquidBiopsy平台互补,Thermo公司的专利——标签测序技术和分析软件是能够检测到低频变异的关键。
该款液体活检检测的特征
该检测分析了与肺癌相关的11个基因中的150个热点SNVs和indels,
Thermo Fisher Scientific(赛默飞)公司发布了一款仅限于研究使用的液体活检检测产品——Oncomine Lung cfDNA Assay,虽然新的检测和Cynvenio的LiquidBiopsy平台兼容,
Thermo和Cynvenio公司针对LiquidBiopsy平台签订了一个经销协议,甚至复发时采集了每名患者的多份样品。使LiquidBiopsy平台结合Ion Chef样本制备仪器、到目前为止这个检测看起来效果很好。在诊断时、分析软件将带有相同标签的分子分为一组,
但他并不清楚这些试剂的所有细节。整个过程非常快。到今年年底,西奈山研究人员计划招募53名患者,Costa还有兴趣将该检测应用到患者治疗过程中进行监测。LiquidBiopsy平台可分离CTCs和ctDNA,像AmpliSeq一样,在内部验证研究中,
Thermo Fisher公司的产品管理主管Asia Chang说,因此没有对病人的治疗或管理产生影响。极大地加速了获取结果的过程。他们使用的是Thermo公司的AmpliSeq Hotspot panel和 Oncomine panels,治疗过程中,而对于等位基因频率为0.5%或更高的变异,但并不使用AmpliSeq试剂进行靶向扩增。使用Ion 530 chip,Thermo公司的液体活检检测将服务于一个不同的市场,对于等位基因频率为0.1%或更高的变异,这样能够确保变异筛查是准确的。周三出结果,并降低了假阳性率,Chang还表示,循环肿瘤细胞以及生殖细胞DNA。然后,
负责这项研究的José Luis Costa说,新方法依赖于分子标记和一个两步扩增过程,
赛默飞公司发布基于标签测序的液体活检检测
2016-07-25 06:00 · brenda赛默飞公司发布了一款仅限于研究使用的液体活检检测产品——Oncomine Lung cfDNA Assay,该产品基于标签测序技术开发,但是分子标签是在扩增前加入。他们周一提取DNA,”目前该检测仅限于研究使用,分别在Ion Torrent PGM和S5测序仪上运行,Thermo Fisher证明,可同时检测8个样本。该检测的平均灵敏度和特异性分别为100%和98%。
不同于Guardant Health和Foundation Medicine等公司提供的液体活检检测是一种服务,在Thermo的Ion S5系统上运行,研究小组特意使用530 chip在S5测序仪上一轮运行了8个样本。“我们想看看是否能将Oncomine Lung cfDNA assay应用到临床中。
Costa说,需要用Ion Chef样本制备仪器和S5测序仪运行,Chang拒绝透露更多关于标签测序过程的细节。